Localizada no Campus de Pesquisa do Museu Paraense Emílio Goeldi, criada em 1894 e especializada em Ciências Humanas e Naturais. Ela preserva aproximadamente 300 mil periódicos, livros, folhetos, separatas e materiais multimídia, incluindo um rico acervo na área das Humanidades, já intensamente utilizado por pesquisadores e estudantes de graduação e pós-graduação. Destaca-se a coleção especial de livros, com cerca de 3.000 mil volumes, infólios e periódicos impressos desde o século XVI. Entre eles, existe uma coleção amazoniana de viajantes e naturalistas, uma das melhores do país. A biblioteca possui um sistema de busca informatizada (Pergamum), além de espaços reservados para estudo, pesquisa e reuniões. Entre os serviços disponibilizados aos docentes e discentes do MPEG, destacam-se a elaboração de bibliografias, fichas catalográficas, localização de obras, buscas de informação, digitalização e reprografia. Anualmente, a biblioteca oferece cursos para estudantes de graduação e pós-graduação sobre o Portal de Periódicos da Capes, bases de dados bibliográficas, repositórios, indexadores e outros recursos para pesquisa.